腐敗希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)屬于革蘭氏陰性菌,適宜低溫下生長,能產(chǎn)生H2S、TMA、CH4SH和(CH3)2S等揮發(fā)性物質(zhì),腐敗潛力強,被確認(rèn)為有氧冷藏海水魚的特定腐敗菌(Specific spoilage organisms,SSO)。研究者針對水產(chǎn)品腐敗希瓦氏菌生態(tài)特性、生長動力學(xué)、貨架期預(yù)測、靶向抑制和抑菌機制等進行了探究,研究了環(huán)境因子對大黃魚腐敗希瓦氏菌生長影響的計數(shù)法。研究了復(fù)合生物保鮮劑對腐敗希瓦氏菌的抑菌機理。水產(chǎn)品在加工、銷售、流通和貯藏過程中微生物受內(nèi)在和外在因子的影響,特別在運輸過程中溫度易產(chǎn)生波動,多因子交互作用下可能產(chǎn)生拮抗和協(xié)同作用。
通過設(shè)置“抑菌柵欄”和改變柵欄強度達到抑制微生物的作用。采用微生物生長/非生長(Growth/no growth,N/NG)界面模型可定量分析不同柵欄下目標(biāo)微生物生長的可能性(或概率),獲得不同環(huán)境因子下的生長/非生長信息,定量調(diào)節(jié)水產(chǎn)品內(nèi)外環(huán)境,達到殺滅或抑制作用。微生物生長/非生長界面模型常采用Logistic回歸法,食品中微生物生長/非生長界限模型多為致病菌模型,如單增李斯特菌、黃曲霉菌和蠟樣芽孢桿菌等模型,用于控制微生物毒素的產(chǎn)生,保障食品安全。目前食品腐敗菌模型的開發(fā)相對較少,如乳酸菌和結(jié)合酵母等,通過定量控制微生物的生長/非生長,延長產(chǎn)品的貨架期。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Artificial neural Network,ANN)在食品加工工程中已廣泛應(yīng)用,其中PNN(Probabilistic Neural Network)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法適用于生長/非生長模型的建立,具有結(jié)構(gòu)簡單和訓(xùn)練速度快的特點,可利用線性學(xué)習(xí)算法實現(xiàn)非線性學(xué)習(xí)算法的功能,對微生物生長/非生長數(shù)據(jù)進行快速分類。采用Logistic回歸法和PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法構(gòu)建aw、pH及鹽分交互作用下腐敗希瓦氏菌生長/非生長界面模型未見研究報道。
本文選取魚源腐敗希瓦氏菌為研究對象,研究室溫(25℃)條件下pH、aw及鹽分(NaCl)對菌株腐敗希瓦氏菌生長概率的交互影響,采用二階線性Logistic回歸方程擬合和PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法構(gòu)建環(huán)境因子交互作用下生長/非生長界面模型。旨在評估魚源腐敗希瓦氏菌在pH、aw和鹽分范圍的生長動態(tài),開發(fā)高效抑菌及定量評估方法,為保障海產(chǎn)品鮮度和品質(zhì)安全提供支持。
1材料與方法
1.1試驗材料
菌株D1從低溫有氧貯藏大黃魚貨架期終點時分離,16SrRNA測序鑒定為腐敗希瓦氏菌(序列號:KY786336),4℃保藏。
1.2試驗試劑及儀器
胰蛋白胨大豆肉湯(TSB);胰蛋白大豆瓊脂培養(yǎng)基(TSA);1.0%鹽酸;1.0%氫氧化鈉;甘油和氯化鈉(國藥集團化學(xué)試劑有限公司,上海)。
水分活度儀(AW LAB-Touch PMB35),大昌華嘉商業(yè)中國有限公司;pH計(pHS-3C),上海雷磁儀器廠;微生物生長測定儀(Bioscreen C),芬蘭;潔凈工作臺(SW-CJ-1FB),上海博訊實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠;低溫培養(yǎng)箱(MIR-153),日本三洋公司。
1.3培養(yǎng)基制備
采用TSB作為培養(yǎng)基。25℃時,pH≤5.0或aw≤0.920或NaCl≥12%時,腐敗希瓦氏菌不生長,海水平均鹽度為3.5%,故交互試驗因素和水平設(shè)計如表1所示,選取均分水分活度0.90,0.92,0.94,0.96作為訓(xùn)練集建立模型,為避免誤差選擇具有代表性的相同水分活度0.91為驗證集,計120種工況,每種重復(fù)4次和1個空白平行。通過滅菌甘油調(diào)節(jié)水分活度,0.1 mol/L稀鹽酸和0.1 mol/L氫氧化鈉調(diào)節(jié)pH。
表1腐敗希瓦氏菌pH,aw和鹽分交互試驗設(shè)計
1.4菌懸液制備與接種
菌株活化:取腐敗希瓦氏菌接種于無菌營養(yǎng)肉湯中,振蕩30 s,25℃培養(yǎng)24 h,劃線得到單菌落。
菌株接種:把調(diào)節(jié)過pH、aw和鹽分的TSB經(jīng)121℃滅菌后接入100孔微孔板,每孔180μL,取105CFU/mL的菌懸液20μL,最終接種液濃度為4.5 lgCFU/mL,接種入孔,每個條件4組平行,1個空白,25℃培養(yǎng),每隔1 h測定其OD600nm值,測試周期為7 d。
1.5生長/非生長邊界確定
當(dāng)試驗結(jié)束時,微孔中出現(xiàn)明顯沉淀物或混濁,OD值高于空白3倍則判定為生長,判定為生長時,取微孔中培養(yǎng)液100μL涂布于TSA平板上,驗證菌株是否仍為純菌株。當(dāng)OD值1~3倍之間時,涂布TSA平板驗證,若平板出現(xiàn)典型菌落,
菌數(shù)與初始菌量差>0.5 lgCFU/mL時,則判定為生長。每種情況下的生長概率由重復(fù)孔的生長情況計算獲得,如4孔中2孔生長則該情況下生長概率為50%。
1.6建立生長/非生長模型
1.6.1 Logistic模型建立依據(jù)試驗設(shè)計選取90例數(shù)據(jù)為訓(xùn)練集用來建立模型,Logistic模型如式1所示:
式中:p——生長/非生長概率;bi(0~9)——擬合參數(shù);Na——鹽分(V/V)。
1.6.2 PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型建立PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型是基于Bayes分類規(guī)則與Parzen窗的概率密度函數(shù)估計方法發(fā)展而來的一種并行算法。
將試驗數(shù)據(jù)歸一化后,依據(jù)試驗設(shè)計選取90例數(shù)據(jù),鹽分、pH和aw作為三維向量進入輸入層,在Matlab軟件中進行訓(xùn)練,輸出層神經(jīng)元設(shè)定為1,結(jié)構(gòu)概率≤0.5的記作1類非生長,>0.5的記作2類生長。訓(xùn)練完成后剩余30例數(shù)據(jù)作為驗證輸入,驗證訓(xùn)練模型的準(zhǔn)確性。
1.7模型擬合優(yōu)度及預(yù)測力評價
1.7.1擬合優(yōu)度評價Logistic模型擬合優(yōu)度采用似然比測試(-2lnL,the likehood test)、赤池信息準(zhǔn)則(AIC=-2lnL+2k,Akaike's information criterion)、Hosmer-Lemeshow測試(HL)和R2-Nagelkerke進行評價。-2lnL、AIC常用于模型擬合優(yōu)度評判,數(shù)值越小,證明擬合效果越好。Hosmer-Lemeshow用于評估模型任意數(shù)量的連續(xù)與分散的解釋變量的擬合優(yōu)度,數(shù)值越小,擬合效果越好,但無法將標(biāo)準(zhǔn)偏差納入考慮,一個不理想的預(yù)測值亦可能導(dǎo)致該值的升高,故常結(jié)合R2-Nagelkerke值一起考慮,R2-Nagelkerke值主要反映了解釋變量與響應(yīng)變量間的關(guān)系,其值越接近1,擬合優(yōu)度越好。
1.7.2預(yù)測力評價Logistic模型與PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型預(yù)測力采用C-matrix獲得的一致率(Fraction correct,F(xiàn)C)和假陽性率(False alarm rate,F(xiàn)AR)進行比較,F(xiàn)C值越接近于100%說明預(yù)測效果越好,F(xiàn)C值為預(yù)測值與實際值的吻合度,F(xiàn)AR為假陽性錯判率,可作為模型的預(yù)測準(zhǔn)確度的參考。公式如下:
1.8模型驗證
選取30例數(shù)據(jù)為驗證集對模型進行驗證,帶入建立的Logistic模型與PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型中,采用FC%和FAR%模型驗證的準(zhǔn)確率和預(yù)測力進行評價。
1.9數(shù)據(jù)分析
使用SPSS18.0(美國IBM公司)對模型進行擬合模型,通過Origin9.0(美國OriginLab公司)繪制生長/非生長曲線,PNN人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立采用MatlabR2016b進行建模。
室溫條件下pH、aw及鹽分對腐敗希瓦氏菌生長概率的交互影響(一)
室溫條件下pH、aw及鹽分對腐敗希瓦氏菌生長概率的交互影響(二)
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