1.3.2隨機(jī)擴(kuò)增多片段DNA(RAPD)試驗(yàn)


待測菌液在4℃下12 000g離心5 min,收集菌體用無菌水重懸,加入玻璃珠,95℃加熱5 min,渦旋震蕩5 min,離心后保留上清為DNA模板,-20℃?zhèn)溆?。?0μL PCR反應(yīng)體系:2×Master Mix 10μL,ddH2O 5μL、隨機(jī)引物S23 1μL,4μL DNA模板。PCR擴(kuò)增后進(jìn)行瓊脂糖凝膠分析。


1.3.3產(chǎn)蛋白酶乳桿菌的16S rDNA鑒定


DNA模板制備方法同上。16S rDNA擴(kuò)增反應(yīng)體系50μL:ddH2O 15μL;2×Taq Plus PCR MasterMix 25μL;上游引物27F 1μL;下游引物1492R 1μL;DNA模板8μL。電泳分析檢測菌株單一性,挑選1 500 bp條帶的進(jìn)行序列分析,利用美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)的BLAST工具分析比對序列。


1.3.4菌株生長曲線的測定


將活化菌株按1%的接種量接種至生長曲線測定板中,加入200μL MRS培養(yǎng)基。在Bioscreen C生長曲線測定儀中連續(xù)培養(yǎng)48 h,每隔30 min測定吸光度值(OD 600 nm),并繪制出生長曲線圖。


1.3.5胃酸耐受能力測定


參照李堯等方法,將活化好的菌株離心后用無菌PBS洗滌2次,離心棄上清后分別用pH 2.5的MRS液體培養(yǎng)基重懸。取1 mL pH 2.5的MRS菌體重懸液置于9 mL pH 2.5的MRS液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫培養(yǎng)0、0.5 h和3.0 h后平板計(jì)數(shù),計(jì)算菌存活率(%)。


1.3.6膽鹽耐受能力測定


膽鹽耐受能力測定參考LEBEER等方法稍作修改,將上述洗滌后菌懸液加入到等體積0.2%豬膽鹽培養(yǎng)液中,37℃培養(yǎng)0、0.5、3.0 h后平板計(jì)數(shù),計(jì)算菌存活率(%)。


1.3.7產(chǎn)胞外多糖能力測定


利用苯酚硫酸法測定發(fā)酵液中胞外多糖含量。


1.3.8表面疏水性能力測定


將1 mL二甲苯加入3 mL菌懸液中,震蕩旋轉(zhuǎn)120 s,37℃培養(yǎng)箱靜止120 min,分離有機(jī)相和水相。去除有機(jī)相,以PBS為對照,在600 nm處測定水相的吸光度。疏水性百分比計(jì)算方法如下。


疏水性(%)=(A0-At)/A0×100%


式中:A0為初始時OD 600 nm值;At為反應(yīng)后OD 600 nm值。


1.3.9自聚集能力測定


將4 mL菌懸液震蕩旋轉(zhuǎn)120 s,在室溫(37℃培養(yǎng)箱)下孵育5 h,取1 mL上層清液,測定OD 600 nm吸光度。自聚集百分比計(jì)算方法如下。


自聚集(%)=(1-At/A0)×100%


式中:A0為初始時OD 600 nm值;At為靜止后OD 600 nm值。


1.4數(shù)據(jù)分析


所有試驗(yàn)均獨(dú)立進(jìn)行3次,結(jié)果由平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(X±SD)表示。使用SPSS軟件進(jìn)行單因素方差分析(one-way ANOVA)中沃勒-鄧肯方法進(jìn)行顯著性分析,P<0.05為有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。使用Origin 2021 Pro繪圖。


2結(jié)果與分析


2.1嬰兒糞便中乳桿菌的初步分離篩選


在黑龍江省共采集到16份不同嬰兒糞便樣品,部分乳桿菌的光學(xué)顯微鏡形態(tài)見圖1。顯微鏡下觀察到菌體形態(tài)包括長桿、短桿、彎曲桿及鏈狀。

圖1部分乳桿菌形態(tài)


2.2產(chǎn)蛋白酶乳桿菌的篩選


蛋白水解度實(shí)際上反映的是氨基酸利用與釋放之間的動態(tài)平衡,指標(biāo)并不能直接反映菌株的蛋白酶活性。本試驗(yàn)采用蛋白質(zhì)水解度結(jié)合脫脂乳平板法觀察透明圈直徑共同考察各菌株產(chǎn)蛋白酶情況。


2.2.1蛋白圈直徑和蛋白質(zhì)水解度分析


將分離純化得到的169株乳桿菌接種至12%滅菌脫脂乳發(fā)酵,凝乳結(jié)實(shí)的共72株,將72株乳桿菌放置脫脂乳固體平板中,以未接種并培養(yǎng)24 h后的脫脂乳樣品為對照,觀察其產(chǎn)生透明圈,并測定這些菌株的蛋白水解度。


乳桿菌生長于脫脂乳培養(yǎng)基中時能分解乳中蛋白質(zhì)生成游離氨基酸,不同菌株生成游離氨基酸的能力不同。由圖2可見,11株菌株均產(chǎn)生較為明顯的透明圈,透明圈直徑最大的是菌株T91和T95,均超過19 mm,但它們之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。蛋白質(zhì)水解度分析結(jié)果表明菌株T95的蛋白水解度在所有菌株中最高,可達(dá)到18.61±0.38 mmol/L,且顯著高于其他菌株(P<0.05),其次是菌株N35、N38、T91和S29。所有試驗(yàn)菌株的蛋白水解能力均高于對照菌株LGG和LP_6110。本試驗(yàn)測定結(jié)果略高于張爽等測定69株菌株L-Leu的蛋白水解度,其測定范圍在1.89±0.14 mmol/L~11.60±0.52 mmol/L。

圖2產(chǎn)蛋白酶菌株蛋白水解度和水解圈直徑


2.2.2 RAPD圖譜


RAPD技術(shù)已經(jīng)在微生物基因型識別領(lǐng)域得到廣泛運(yùn)用。為避免篩選出的菌株為同一菌株,以LGG和LP_6110作為對照,采用S23引物對上述試驗(yàn)得到的11株菌進(jìn)行PCR擴(kuò)增,剔除條帶和來源相同的菌株,最終挑選出8株性狀各不相同的乳桿菌,得到RAPD圖譜見圖3。由圖3可見,不同菌株之間的電泳圖有差異,菌株S21和P59比較相似,但來源于不同樣品,在光學(xué)顯微鏡下菌體形態(tài)差異較大,因此也將2株菌進(jìn)行了保留。

圖3 8株產(chǎn)蛋白酶菌株RAPD電泳


2.2.3菌株16S rDNA序列同源性分析


將得到的8株菌進(jìn)行PCR擴(kuò)增和瓊脂糖凝膠電泳,電泳條帶明亮清晰且分子質(zhì)量皆在1 500 bp左右,符合測序要求。將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序并拼接,在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行比對(http://www.ncbi.nlm.nin.gov/BLAST)。序列比對結(jié)果見表1。所有菌均為鼠李糖乳酪桿菌(Lacticaseibacillus rhamnosus)。

表1 NCBI BLAST比對結(jié)果


相關(guān)新聞推薦

1、微生物生長曲線分析儀首次記錄蠟樣芽孢桿菌在太空飛行期間各種變化

2、?高濃度的含鹽廢水對微生物的影響

3、微生物生長曲線分析儀及其應(yīng)用技術(shù)研究進(jìn)展

4、芽孢桿菌對黃曲霉毒素B1、嘔吐毒素、玉米赤霉烯酮的降解作用——結(jié)果、結(jié)論

5、牦牛源多殺性巴氏桿菌C47-8株生長曲線測定與研究