人類胃腸道樣本采集
糞便
a.成年人糞便
1)在收集糞便樣本前將尿液排盡,避免尿液污染糞便。將無菌糞便收集盒(或其他無菌收集器)放入蹲式(或坐式)馬桶后排便,確保糞便排入盒中。
2)將手洗干凈或戴上無菌手套,擰開2mL無菌凍存管蓋,將滅菌拭子的棉頭插入糞便中,并輕微攪動。
※注意:因糞便表層含有腸粘膜脫落細(xì)胞,而外部容易污染,且接觸空氣后,部分細(xì)菌DNA開始降解,所以取樣時應(yīng)取中段內(nèi)部的糞便樣本。
3)用拭子取黃豆大?。s50mg)樣本放入螺口凍存管,取出棉簽,旋緊凍存管蓋。一式三管,一管用于測序?qū)嶒灒硗鈨晒軅浞荨?
4)將凍存管放入自封袋中,并封緊,馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中,在短時間(最長不超過4h)送至實驗室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存,防止反復(fù)凍融。
b.嬰兒糞便
1)在收集糞便樣本前將尿液排盡,避免尿液污染糞便。
2)帶一次性無菌手套,將新鮮糞便收集到無菌糞盒里,或采用潤滑的無菌醫(yī)用拭子對會陰部刺激促進(jìn)排便。然后用無菌拭子挑取糞便至無菌螺口凍存管,一式三管,每管約50-100mg,一管用于測序?qū)嶒?,另外兩管備份?
3)將凍存管放入自封袋中,并封緊,馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中,在短時間(最長不超過4h)送至實驗室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。防止反復(fù)凍融。
肛拭子/直腸拭子
1)不易獲得糞便時,可采用直腸拭子法進(jìn)行腸道微生物樣本的采集。
2)使用肥皂、水和70%的酒精分別清潔肛門周圍,然后將無菌拭子用生理鹽水濕潤后插入肛門4~5cm(幼兒2~3cm)肛門括約肌處輕柔的旋轉(zhuǎn),于肛門隱窩處取樣(拭子上明顯可見糞便痕跡),每個樣本提供3-5個拭子。
3)然后插入無菌凍存管(或?qū)⒚奘米宇^部剪落入凍存管中),旋緊蓋子,馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中。
4)在短時間(最長不超過4h)送至實驗室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。
腸道灌洗液
1)將腸道灌洗液低速離心(800-1000g離心5min)收集上清液,將上清液過0.22μm可拆卸的濾膜,收集濾膜;放入-80℃冰箱保存。
2)或者將腸道灌洗液先低速離心(800-1000g離心5min)收集上清液,然后將上清液12,000g離心10min,棄上清保留沉淀,然后將沉淀管裝入自封袋密封,放-80℃冰箱保存。
人類泌尿生殖道樣本采集
宮腔分泌物/陰道分泌物(拭子)
1)48h內(nèi)無性行為,不得進(jìn)行私處清洗、上藥等改變菌群結(jié)構(gòu)的行為,30d內(nèi)不能用抗生素和抗真菌類藥物。
2)將采樣拭子伸入需要取樣部位,按壓深度約為拭子直徑,來回滾動擦拭四次,以覆蓋整個拭子,然后取出。采集2~3根拭子。
3)將拭子插入無菌凍存管(或?qū)⑹米宇^部剪落入凍存管中),旋緊蓋子,馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中,在短時間(最長不超過4h)送至實驗室進(jìn)行DNA抽提或-80℃保存。
尿液
1)采集尿液之前用中性肥皂水或者清水對尿道口周圍進(jìn)行清潔。
2)集受試者晨尿的中段尿液50mL左右(中段尿:在排尿過程中,棄去前、后時段排出的尿液,以無菌容器收集中間時段的尿液;或在開始排尿3s后采集尿液,當(dāng)尿液量達(dá)到50mL,即認(rèn)為完成收集)。
3)將尿液樣本馬上放入裝有碎冰或冰袋的保溫盒中,在短時間(最長不超過4h)送至實驗室進(jìn)行菌體富集。尿液在4℃,1000g離心5min;取上清繼續(xù)10,000g離心5min富集菌體(需達(dá)到0.2-0.3g)。將沉淀立即置于-80℃保存。
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