1.3.2細(xì)菌16S rDNA鑒定
采用DNA提取試劑盒提取腐敗菌的DNA,以通用引物27F(5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’)和1492R(5’-TACCTTGTTACGACTT-3’)對(duì)目標(biāo)細(xì)菌的V 3區(qū)進(jìn)行P C R擴(kuò)增。5 0μL P C R擴(kuò)增體系:2×Taq Master Mix 25μL,DNA模板1μL,引物(10μmol/L)各1.5μL,ddH2O 21μL。PCR擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性10 min;95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán);最后72℃再延伸10 min。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物通過(guò)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),將條帶清晰的擴(kuò)增產(chǎn)物送往生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)www.NCBI.nlm.gov./blast網(wǎng)站進(jìn)行序列同源性比對(duì)。
1.3.3 PCR-DGGE分析
1.3.3.1微生物總基因組DNA提取
樣品處理同1.3.1節(jié),采用細(xì)菌DNA提取試劑盒提取4℃貯藏6 d調(diào)理牛排的總DNA。
1.3.3.2 PCR擴(kuò)增
PCR擴(kuò)增采用帶GC夾子的特異性引物U968-GC(CG CCCGGGGCGCGCCCCGGGCGGGGCGGGGGCA CGGGGGGGAACGCGAAGAACCTTAC)和L1401(CGGTGTGTACAAGACCC)對(duì)細(xì)菌16S rDNA的V6~V8區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。25μL PCR擴(kuò)增體系為:2×Taq Master Mix 12.5μL,DNA模板1μL,引物(10μmol/L)各1.5μL,ddH2O 8.5μL。PCR擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性10 min;95℃變性30 s,56℃退火30 s,72℃延伸30 s,32個(gè)循環(huán);最后72℃再延伸10 min。
1.3.3.3 DGGE
使用8%聚丙烯酰胺凝膠,采用40%~60%的變性膠。將灌好膠的玻璃板放入電泳槽內(nèi)升溫至60℃,130 V預(yù)跑膠20 min。點(diǎn)樣20μL,200 V、90 mA高壓預(yù)跑膠10 min后,85 V、50 mA恒壓下電泳16 h。電泳結(jié)束后,將變性膠放入50 mL 1×TAE電泳緩沖液(含5μL Gel-Green DNA染色劑)染色30 min。用ddH2O漂洗2~3次后用化學(xué)發(fā)光儀系統(tǒng)拍照。
1.3.3.4 DGGE條帶回收與測(cè)序
將變性膠置于紫外條件下,用無(wú)菌手術(shù)刀切下各泳道的主要條帶,溶于盛有20μL TE緩沖液的PE管中,4℃過(guò)夜提取DNA。以回收的DNA為模板,以U968(AACGCGAAGAACCTTAC)(無(wú)GC夾子)和L1401(CGGTGTGTACAAGACCC)為引物進(jìn)行擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系和條件同1.3.3.2節(jié)。
1.3.4 CEO、CSEO、BPEO抑菌性能測(cè)定
1.3.4.1抑菌圈直徑
將優(yōu)勢(shì)腐敗菌接種于LB瓊脂培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)24 h。用無(wú)菌生理鹽水調(diào)節(jié)制成106 CFU/mL的菌懸液,置于4℃冰箱備用。用無(wú)菌棉簽蘸取菌液,在培養(yǎng)基上劃線涂布。將6 mm的無(wú)菌空白藥敏紙片放置于培養(yǎng)基上,分別滴加10μL CEO、CSEO、BPEO,每皿4片,以無(wú)菌生理鹽水為空白對(duì)照。在4℃冰箱中放置4 h,使精油在含菌平板上自紙片中心向外圍擴(kuò)散,隨后放入各溫度培養(yǎng)箱培養(yǎng)16~24 h。用游標(biāo)卡尺測(cè)量抑菌圈直徑。抑菌作用判斷:抑菌圈直徑>20 mm為高度敏感;10~20 mm為中度敏感;6~10 mm為低度敏感;<6 mm為無(wú)抑菌作用。重復(fù)3次實(shí)驗(yàn)均有抑菌作用的結(jié)果判為合格。
1.3.4.2最小抑菌濃度(minimum inhibitory concentrate,M I C)和最小殺菌濃度(m i n i m u m b a c t e r i c i d a l concentrate,MBC)
采用二倍稀釋法測(cè)定精油的MIC與MBC。分別吸取一定量的CEO、CSEO、BPEO,加入1%(V/V)吐溫-80無(wú)菌水溶液,使其體積濃度為64μL/mL。吸取1 mL上述植物精油溶液,加入LB培養(yǎng)基,將其體積濃度依次稀釋為32.0、16.0、8.0、4.0、2.0、1.0、0.5μL/mL,最后一管移取1 mL植物精油溶液。每個(gè)試管中加入等體積的菌懸液,在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)16~24 h,若溶液呈現(xiàn)澄清狀態(tài),對(duì)應(yīng)的植物精油體積濃度則為MIC。蘸取澄清試管中的溶液劃線,24 h未長(zhǎng)菌的植物精油體積濃度即為MBC。
1.3.4.3細(xì)菌生長(zhǎng)曲線
各精油的細(xì)菌生長(zhǎng)曲線通過(guò)光密度測(cè)定,吸取一定量的植物精油和菌懸液置于酶標(biāo)板,使精油體積濃度分別為MIC和2MIC,放入培養(yǎng)箱培養(yǎng),每隔2 h取出測(cè)定OD600 nm。實(shí)驗(yàn)重復(fù)操作3次,每次設(shè)置3個(gè)平行,記錄并繪制生長(zhǎng)曲線。
1.4數(shù)據(jù)處理
使用IBM SPSS Statistics 26.0對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行單因素方差分析,結(jié)果用平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,并以Duncan檢驗(yàn)進(jìn)行顯著性(以P<0.05為差異顯著)標(biāo)記。
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